Igra je razvijena u tajnom laboratoriju koji se nalazi na dnu oceana. Ovdje u samoći živi ekscentrični znanstvenik, iskustva i pokusa kolege ga kriviti. Njegov glavni zadatak bio je stvoriti živo biće obdareno razumom i godina kasnije on je to učinio. Ali, u isto vrijeme i kreator je nestao pod nerazjašnjenim okolnostima, ostavljajući Goo (to je ime dobila potomstvo) i čekati ga propustiti. Hero umorni od vješanje u tikvicu-kamera i izaći iz nje, on je otišao na turneju po kompleksa pronaći tragove nestalog prijatelja. Sposobnost da odaberete stupanj elastičnosti će pomoći u prevladavanju raznih prepreka, nositi se s neprijateljem i prodrijeti do mjesta gdje je običan čovjek ili kako ne bi dobili.